با توجه به این که رسالت آموزش پژوهش و پژوهشگری در مقاطع مختلف پزشکی به عهده معاونت پژوهشی است، تلاش گردیده که این مهم از طریق تاکید بر سطح پژوهشی در حوزه پایاننامههای در سطح پزشکی عمومی و نیز در سطح دستیاری تخصصی و فوقتخصصیی فراهم آید. همچنین در مورد اعضای هیات علمی دانشکده پزشکی، معاونت پژوهشی رسالت ایجاد و فراهمسازی بستر و امکانات مناسب برای پژوهشهای مبتنی بر نیازهای سلامت جامعه را برعهده گرفته است و در این حوزه علاوه بر برگزاری دورههایی در راستای توانمندسازی پژوهشی اعضای هیات علمی، در تامین بودجه مورد نیاز برای طرحهای پژوهشی تلاش میکند.